BadregionFinder.

DOI：10.18129 / b9.bioc.badregionfinder.

BadregionFinder：用于识别具有不良覆盖区域的R / Biocuconductor包

Biocometiond版本：释放（3.12）

BadRegionFinder是一种用于识别区域的序列对齐数据中具有糟糕，可接受和良好的覆盖范围的包装。可以考虑整个基因组以及一组目标区域。可提供各种视觉和文本类型的输出。

作者：莎拉桑曼

维护者：萨拉桑德曼

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！quancamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“badregionfinder”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“BADREGIONFINDER”）

PDF.	r script.	使用badregionfinder
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文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.18.0
在生物导体中以来	BIOC 3.3（R-3.3）（5年）
执照	LGPL-3
依靠
进口	VariantAnnotation.那RSAMTOOLS.那生物雕那Genomicranges.那S4Vectors.，utils，stats，grdevices，图形
链接到
建议	bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	badregionfinder_1.18.0.tar.gz.
Windows二进制文件	badregionfinder_1.18.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	badregionfinder_1.18.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/badregionfinder.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ badregionfinder
包短网址	https://biocumon.org/packages/badregionfinder/
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