BAYESSPACE

doi：10.18129/b9.bioc.bayesspace

空间转录组的聚类和分辨率增强

生物导体版本：版本（3.13）

用于聚类和增强空间基因表达实验的分辨率的工具。BAYESSPACE将基因表达矩阵的低维表示，在鼓励相邻斑点聚集在一起之前结合了空间。该方法可以将低维表示的分辨率提高到“子点”中，为此，可以估算基因表达或细胞类型组成等特征。

作者：爱德华·赵[AUT]，Matt Stone [AUT，CRE]，Xing Ren [CTB]，Raphael Gottardo [CTB]

维护者：Matt Stone

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ bayesspace”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Bayesspace”）

html	R脚本	BAYESSPACE
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.2.0
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（0.5岁）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	r（> = 4.0.0），Singlecellexperiment
进口	RCPP（> = 1.0.4.6），统计，purrr，，，，评分，，，，斯克兰，，，，总结性特征，，，，结尾，，，，RHDF5，，，，S4VECTORS，，，，矩阵，，，，断言，，，，mclust，，，，rcurl，，，，dirichletreg，，，，xgboost，utils，GGPLOT2，，，，秤，，，，Biocfilecache，，，，生物兴奋
链接	RCPP，，，，rcpparmadillo，，，，rcppdist，，，，rcppprogress
建议	测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，Igraph，，，，空间Libd，，，，dplyr，，，，维里迪斯，，，，拼布，，，，rcolorbrewer，，，，Seurat
系统要求	C ++ 11
增强
URL	Edward130603.github.io/bayesspace
BugReports	https://github.com/edward130603/bayesspace/issues
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进口我
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	BAYESSPACE_1.2.0.TAR.GZ
Windows二进制	BAYESSPACE_1.2.0.ZIP（32-和64位）
MacOS 10.13（高山脉）	BAYESSPACE_1.2.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bayesspace
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：套餐/bayesspace
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/bayesspace/
软件包下载报告	下载统计