BGEedB.

DOI：10.18129 / b9.bioc.bgebedb.

BGEE数据库的注释和基因表达数据检索。Topanat，Uberon本体的解剖实体浓缩分析工具

Bioconductor版本：释放（3.13）

来自BGEE数据库的注释和基因表达数据的包装，以及Topanat分析：通过表达模式映射到基因的解剖学术语等富集。

作者：Andrea Komljenovic [Aut，Cre]，Julien Roux [Aut，CRE]

维护者：Julien Wollbrett ，Julien Roux ，Andrea Komljenovic ，Frederic Bastian

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percenamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“bggeedb”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“BGGEDB”）

HTML.	r script.	BGEedB，R包，用于检索愈合表达数据集和基因列表浓缩测试
PDF.		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	2.18.0
在生物导体中以来	BIOC 3.3（R-3.3）（5年）
执照	gpl-3 +文件执照
依靠	r（> = 3.6.0），顶点那Tidyr.
进口	data.table.那卷曲那rcurl.那消化，方法，统计数据，utils，dplyr.那rsqlite.那图形那BioBase.
链接到
建议	kn那生物焦那testthat.那RAMAMAMDOW.
系统要求
加强
URL.	https://github.com/bgeedb/bgebeedb_r.
Bugreports.	https://github.com/bgeedb/bgebeedb_r/issues.
取决于我
进口我	psygenet2r.那ritan.
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	bgeedb_2.18.0.tar.gz.
Windows二进制文件	bgeedb_2.17.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	bgeedb_2.18.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/bgebeedb.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ bgeedb
包短网址	https://biocumon.org/packages/bgeedb/
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