比法特

doi:10.18129/b9.bioc.bifet

无偏置足迹富集测试

生物导体版本:版本(3.13)

BIFET确定了TFS在纠正目标区域和背景区域之间的读数和GC内容不平衡引起的偏差之后,与背景区域相比,目标区域中的足迹在目标区域相比具有过高的代表性。对于给定的TF K,BIFET检验了零假设,即目标区具有相同的概率,即在校正读数计数和GC含量偏置的同时对TF K作为背景区域具有足迹。为此,我们将带有TF K,T_K足迹的目标区域数量用作测试统计量,并将P值计算为观察T_K或更多目标区域的概率,并在零假设下使用足迹。

作者:Ahrim Youn [AUT,CRE],Eladio Marquez [AUT],Nathan Lawlor [AUT],Michael Stitzel [aut],Duygu Ucar [aut]

维护者:ahrim Youn

引用(从r内,输入引用(“ Bifet”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ bifet”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Bifet”)

html R脚本 使用Bifet的指南
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 1.12.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(3年)
执照 GPL-3
要看
进口 统计,Poibin,,,,基因组机
链接
建议 测试,,,,尼特
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 bifet_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 bifet_1.12.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) bifet_1.12.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bifet
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/bifet
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/bifet/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题: