Biggr

doi:10.18129/b9.bioc.biggr

使用代谢重建数据库中基于约束的建模

生物导体版本:版本(3.15)

该软件包提供了一个接口,以模拟BIGG数据库(http://bigg.ucsd.edu/)和其他代谢重建数据库中的代谢重建。该软件包促进了通量平衡分析(FBA)和可行通量分布的采样。代谢网络和估计通量可以用超图可视化。

作者:Anand K. Gavai,Hannes Hettling

维护者:Anand K. Gavai ,Hannes Hettling

引用(从r内,输入引用(“ biggr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Biggr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ biggr”)

PDF R脚本 Biggr
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

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版本 1.32.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(8。5年)
执照 文件执照
要看 r(> = 2.14.0),RSBML,,,,HyperDraw,,,,,,,,Stringr
进口 超图,,,,limsolve
链接
建议
系统要求
增强
URL //www.andersvercelli.com/
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 biggr_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 biggr_1.32.0.zip
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biggr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/biggr
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/biggr/
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