Biobase

DOI:10.18129 / B9.bioc.Biobase

生物碱:生物导体的基本功能

Biocometiond版本：释放（3.12）

许多其他包或替换R功能所需的功能。

作者：R. Gentleman，V. Carey，M. Morgan，S. Falcon

Maintainer: Bioconductor Package Maintainer < Maintainer at Bioconductor。org>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“biobase”）

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文件

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“Biobase”)

PDF.	R脚本	生物碱基和表达集的介绍
PDF.	R脚本	esapply介绍
PDF.	R脚本	eSet开发人员注意事项2021欧洲杯体育投注开户
PDF.		参考手册
文本		新闻

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	2.50.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 15.5年)
许可证	艺术-2.0
取决于	R (> = 2.10),生物根系（> = 0.27.1），UILS
进口	方法
链接
建议	工具，tkWidgets，全部，RUnit，golubEsets
SystemRequirements
加强
URL	//www.andersvercelli.com/packages/Biobase
BugReports	https://github.com/bioconductor/biobase/issues.
取决于我	ACME，affy，affycomp，affycompData，Affycontam.，affycoretools，affyPLM，affyqcreport.，agdex.，Agimicrorna.，目的，全部，altcdfenvs.，annaffy，annotationdbi.，annotationforge.，antiProfilesData，ArrayExpress.，Arraymvout.，ArrayTools.，autotuner.，包，Bcellviper.，Beadarray.，beadarrayExampleData，beadarraysnp.，BGX.，双黑色，大梅隆，Bioccasestudies.，bioDist，BiomVccClass.，Bioqc.，biosigner，bladderbatch，布尔玛，脑创意，Bradata.，相机，CancerClass，CARMADDATA.，卡斯珀，类别，CompoundationCompare.，CCL4.，ccpromise.，cellHTS2，Ceu1kg.，ceuhm3，CGHBase.，CGHcall，Cghregions.，嵌合体，clippda，CLL.，Clusterstab.，CMA.，cn.farms，codelink，colonCA，兑换，COPA，covEB，covRNA，CRCL18，施用布莱特塔，curatedMetagenomicData，davidTiling，DESeq，DEXSeq，DFP，挖掘，diggitdata，DLBCL，DOPPELGANGR.，梳妆台，dsQTL，DSS，dualKS，染料纤维，ebarrays.，EDASeq，边缘，EGSEA.，eisa，Epigenomix.，Epivizrdata.，ETEC16S.，EuPathDB，eximir.，表达式，法比亚，Fabiadata.，factDesign，fastseg，纤维树脂，flowBeads，frma.，gaga，喘气，Geneanswers.，GeneExpressionSignature，GeneMeta，geneplotter，GenereCommender.，Generegionscan.，GeneSelectMMD，Genetclassifier，GEOquery，ggdata.，goexpress.，凑功能，golubEsets，Goprofiles.，古司裤，GSE62944，GSEABase，GSEABenchmarkeR，GSEALM，GSVAdata，Gwastools.，Hapfabia.，哈巴普，帮助，hiiragi2013，HMYRIB36.，hopach，HTqPCR，humanaffydata.，人力系统，HybridMTest，IBMQ.，iCheck，IdeoViz，Idiogram.，inpas.，检查，等压线，iterativeBMA，iva，Iyer517，kidpack，leeBamViews，白血病eset，lumi.，lumiBarnes，摇曳，马特，made4，maEndToEnd，mapkl.，MAQCsubset，maqcsubsetafx.，maqcsubsetilm.，massiR，餐，metabomxtr.，metagenomeFeatures，MetagenomeSQ.，MetaGxBreast，MetaGxOvarian，梅拉维兹尔，MethPed，methyAnalysis，弥撒，Mfuzz，米希普，microbiomeExplorer，mimager，含羞草，MineICA，幻影，Mircomp.，miRNATarget，ml interfaces，mmdiff2.，MmPalateMiRNA，单片，MSD16S.，MSnbase，穆尔姆姆，多atAdataset.，乘，mvoutdata.，纳斯特林德德，Neve2006.，噪音，nondetects，normalize450K，诺斯QPCR.，oligo.，omicRexposome，OrderedList.，otubase.，OutlierD，PADOG，潘达尔，panp，pcaMethods，PCOT2.，pdInfoBuilder，pepStat，PGSEA，phenoTest，pl，普拉斯，普拉达，预先，PREDAsampledata，Prodata.，pRolocGUI，承诺，prostatecancercamcap.，prostateCancerGrasso，prostateCancerStockholm，Prostatecancertaylor.，prostateCancerVarambally，PumaData.，QPcrnorm.，qplexAnalyzer.，R453Plus1Toolbox，RBCBook1.，rbsurv，rcellminer，rcellminerData，ReadQPCR.，犹太人的尊称，RefPlus，rexposome.，林格，Risa.，Rmagpie，RNAinteract，rnaSeqMap，rnits.，角色威力，ropls，RpsiXML，RTCA，rtopper，RUVnormalizeData，RUVSeq，安全的，扫描。通用产品，SeqGSEA，秒杀，SigCheck，siggenes.，simpleaff.，Simulatorz.，singleCellTK，spec，sp，SpikeInSubset，spkTools，泼丝体，Strome4.，SummarizedExperiment，TCGAcrcmiRNA，tcgacrcmrna.，TDARACNE，蒂格雷，tilingArray，顶点，TPP.，tRanslatome，Tspair.，tweedeSeqCountData.，暮，撤销，variancepartition.，VegaMC，毒蛇，vsn，西瓜，webbioc.，XCMS.，XDE，纱，yeastCC
进口我	A4Base.，a4Classif，A4Core.，a4preproc.，ABarray，高手，aCGH，adsplit.，affyILM，affyqcreport.，Agimicrorna.，ANF.，annmap，注释，AnnotationHubData，annotationtools.，ArrayExpresshts.，ArrayqualityMetrics.，ArrayTools.，吸引，舞会礼服，基础知识，Bayesknockdown.，BGEedB.，biobroom，生物扫描，Biocviews.，二乙衫，BioSeqClass，Biscuiteer.，Biseq.，blima，Bloodcancermultiomics2017，脑创意，BSSeq.，BubbleTree，咖啡馆，癌症，红衣主教，CcTutorial.，cellscore.，蜂窝线，Ceu1kgv.，cgdv17.，chnnormaliter.，ChIPQC，ChIPXpress，ChromHeatMap，ChromSchitch.，西塞罗，限幅器，CluMSID，cn.mops，可可，coexnet，cogena.，结合，ConsensusClusterPlus，consensusDE，达人古怪，cord，CoreGx，crlmm，CrossICC，Crossmeta.，ctggem.，腰带，循环，Cydar.，CytoML，CytoTree，达巴马尔，DDCT.，黛米卡，迪科，重新评估，DESeq2，desousa2013，命运，diffloop，不和谐的，easyrnaseq.，ebarrays.，ecolitk，天哪，ENmix，Ensembldb.，erma，esetVis，eximir.，exomePeak2，ExpressionNormalizationWorkflow，农场，ffpe，findmyfriends.，fletcher2013a.，flowClust，流量计，flowFP，flowMatch，FlowMeans.，弗洛克斯普克斯，fl，流动的东西，flowtype.，flowUtils，flowViz，flowWorkspace，FourCSeq，弗雷泽，frma.，frmaTools，funcisnp.，GAPGOM，gCrisprTools，gcrma，GCSScore.，GenBankr.，Geneclassifiers.，Genefilter.，GeneMeta，GenereCommender.，Generegionscan.，创世纪，GenomicFeatures，GenomicInteractions，基因组织，地质副本，gep2pep，gespeR，GGBase.，ggbio，GGTools.，girafe，GISPA，GlobalAncova，globaltest，GMAPR.，凑功能，gQTLstats，GSRI，GSVA，GVIZ.，Harshlight，缝，hgu133plus2CellScore，HTqPCR，HTSFilter，ihwpaper.，imageHTS，免疫思考，拖累2.，infinityFlow，InTAD，IsogeneGui.，isomiRs，迭代，JunctionSeq.，KeggandmetAcoredZpathwaysGego.，KEGGdzPathwaysGEO，kissDE，Lapmix.，丽，LiquidAssociation，LRBaseDbi，Maanova.，MAGeCKFlute，makecdfenv.，maSigPro，桅杆，mBPCR，mcsurvdata，MeSHDbi，metaArray，METASEQR2.，methyAnalysis，MethylAid，methylCC，弥撒，MFA.，米希普，microbiomeDASim，MIGSA，minfi，MinimumDistance，MIPP.，米拉，Mirsm.，missMethyl，MLSEQ.，mmapp2.，MmPalateMiRNA，遐，沼泽，moonlightr.，MOSim，MSEADbi，msnid.，MultiAsaySayexperiment.，多股票，mzR，nanostringqcpro.，ncdfFlow，armanalyzerde.，npGSEA，核核酸，OGSA.，oligoClasses，omicade4，ontoProc，openCyto，oposSOM，逆口，OrganismDbi，panp，pathwaysplice.，PCHENO.，phantasus，Pharmacogx.，phemd，文学，钢琴，紫红色，plgem，钳子，podkat，p，帖子，PPISTATS.，普拉达，预先，王子，proBatch，挑战，后代，ProMoC.，prolocdata.，承诺，道具，ProteomicsAnnotationHubData，Psea.，psygenet2r.，彪马，pvac，pvca，粉末，qcmetrics.，QDNASEQ.，QFeatures，qpgraph，quantro，Quasr.，QUusage.，radiogx.，randPack，ReportingTools.，休息，RGalaxy，河，Rmagpie，RMassBank，rnainteractmapk.，的方式，腐烂，rqubic，rscudo.，RTPCA.，Rtreemix，Ruvnormalize.，Sagx.，scmap，scTGIF，SEQC，SEQVARTOOLS.，ShortRead，signaturesearchData.，SigsPack，sigsquared，simbindprofiles.，simpleaff.，斯嘉西尔，SLGI，屏，SomaticSignatures，spkTools，海绵，议案，潜艇，synapter，TEQC.，TFBStools.，时间课程，TMixClust，三硝基甲苯，ToPASeq，Topdownr.，ToxicoGx，tradeSeq，ttmap.，暮，Usort.，香草，VariantAnnotation.，变型滤波器，VariantTools，vidger.，火神，西瓜，WPM.，Xbseq.，Xeva，yri1kgv
建议我	AUCell，Bioccasestudies.，BiocCheck，生物根系，BiocOncoTK，biotmleData，breastCancerMAINZ，breastCancerNKI，breastCancerTRANSBIG，乳房公务员，乳腺癌，Breastcancervdx.，BSgenome，CcTutorial.，CellMapper.，cellTree，clustComp，COSEQ.，countblust.，镖，dcanr.，dearseq，多萝西娅，dyebiasexamples，edger.，EnMCB，EpiDISH，Epivizr.，epivizrChart，epivizrestalone.，农场，genefu，Genie3.，Genomicranges.，GSAR.，GSgalgoR，散热，HMP16SData，hmp2data.，interactiveDisplay，烤肉串，莱斯，limma，Logolas，M3Drop.，mammaPrintData，mapkldata.，mCSEA，梅斯娜，methyvimData，MSA.，multiClust，OSAT，pcatools.，pkgDepTools，rcistarget.，ReactomeGSA，重新平行，rheumaticConditionWOLLBOLD，鹏，RTCGA.，撒尿，抚慰，食物，SeqArray，七百年人，sl，spatialHeatmap，stager.，survcomp，TargetScore，TCGAbiolinks，tfutils.，TimeSeriesExperiment，tkWidgets，TypeInfo.，vbmp，widgetTools，yeastexpdata.，YeaStrnaseq.
链接给我
建立报告

包档案包

遵循2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	Biobase_2.50.0.tar.gz
Windows二进制	Biobase_2.50.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	Biobase_2.50.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Biobase
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.biocondion.org：包/生物酶
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Biobase/
包下载报告	下载统计信息