BiocFileCache

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocFileCache

跨会话管理文件

生物导体版本:发布(3.13)

这个包创建一个持久的磁盘上的文件缓存，用户可以添加、更新和检索这些文件。它对于管理创建成本高或困难的资源(如自定义Txdb对象)、web资源和跨会话使用的数据文件非常有用。

作者:Lori Shepherd [au:]， Martin Morgan [au:]

维护者:Lori Shepherd < Lori。牧羊人在roswellpark.org >

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install(" BiocManager"， quiet = TRUE)

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BiocFileCache”)

超文本标记语言	R脚本	BiocFileCache:跨会话管理文件资源
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	2.0.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (R-3.4)(4年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.4.0),dbplyr(> = 1.0.0)
进口	方法、统计跑龙套,dplyr，RSQLite，DBI，rappdirs，filelock，旋度，httr
链接
建议	testthat，knitr，BiocStyle，rmarkdown，rtracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Bioconductor/BiocFileCache/issues
取决于我	AnnotationHub，ExperimentHub，RcwlPipelines，TMExplorer
进口我	意大利苦杏酒，atSNP，自治，BayesSpace，BiocPkgTools，biomaRt，BrainSABER，brendaDb，cbaf，cBioPortalData，CellBench，conclus，CTDquerier，customCMPdb，dasper，drugTargetInteractions，easyRNASeq，EnrichmentBrowser，EpiTxDb，fgga，GAPGOM，GenomicScores，GenomicSuperSignature，GSEABenchmarkeR，gwascat，杂环胺，HCABrowser，HCAExplorer，HCAMatrixBrowser，MBQN，netDx，ontoProc，org.Mxanthus.db，Organism.dplyr，PANTHER.db，psichomics，recount3，recountmethylation，regutools，RiboDiPA，rpx，SingleCellMultiModal，SingscoreAMLMutations，SpatialExperiment，spatialHeatmap，spatialLIBD，TFutils，tximeta，UMI4Cats，uncoverappLib，UniProt.ws，waddR
建议我	AnnotationForge，bambu，BiocOncoTK，BiocSet，chipseqDB，emtdata，fluentGenomics，HiCDCPlus，HighlyReplicatedRNASeq，HumanTranscriptomeCompendium，MethReg，MethylSeqData，msigdb，Nebulosa，后代，scRNAseq，seqsetvis，simpleSingleCell，structToolbox，TCGAutils，TENxBrainData，TENxPBMCData，TimeSeriesExperiment，zellkonverter
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	BiocFileCache_2.0.0.tar.gz
Windows二进制	BiocFileCache_2.0.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	BiocFileCache_2.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocFileCache
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BiocFileCache
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BiocFileCache/
包下载报告	下载数据