Biocneighbors.

DOI：10.18129 / b9.bioc.biocneighbors.

最接近的Bioconducts封装检测

Bioconductor版本：释放（3.13）

实现最近邻检测的精确且近似方法，在允许它们在生物导体包或工作流中轻松切换的框架中。可以使用K-Meanse的K-Meanse来执行精确的搜索，或者使用Vantage Point树来执行。可以使用骚扰或HNSW库执行近似搜索。搜索欧几里德或曼哈顿距离。通过使用Biocomallel平行来实现所有方法的并行化。还提供功能以搜索给定距离内的所有邻居。

作者：Aaron LUN [AUT，CRE，CPH]

维护者：Aaron LUN

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“biocneborbors”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“Biocneighbors”）

HTML.	r script.	1.检测精确的最近邻居
HTML.	r script.	检测近似最近邻居
HTML.	r script.	3.检测范围内的邻居
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.10.0
在生物导体中以来	BIOC 3.8（R-3.5）（2.5岁）
执照	GPL-3.
依靠
进口	rcpp.那S4Vectors.那生物相投，统计，方法，矩阵
链接到	rcpp.那rcpphnsw.
建议	testthat.那生物焦那kn那RAMAMAMDOW.那Fnn.那rcppannoy.那rcpphnsw.
系统要求	C ++ 11.
加强
URL.
取决于我	OSCA.advanced，OSCA.Workflows.
进口我	batchelor.那吹风丝那cellmixs.那Cydar.那cytotree那mil那穆斯萨那撒尿那scdblfinder.那单歌者
建议我	traometoryutils.那TSCan.
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	biocneighbors_1.10.0.tar.gz.
Windows二进制文件	biocneighbors_1.10.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	biocneighbors_1.10.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/biocneighbors.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/生物导电
包短网址	https://biocumon.org/packages/biocneighbors/
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