Bioconcotk.

DOI：10.18129 / b9.bioc.bioconcotk.

一般癌症基因组学的生物导体组分

Bioconductor版本：释放（3.13）

提供各种工具的中央界面，用于癌症研究的基因组规范分析。

作者：Vince Carey

维护者：vj carey

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“bioconcotk”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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Browsevignettes（“Bioconcotk”）

HTML.	r script.	Bioconcotk - 生物导体的癌症取向组分
HTML.	r script.	CutatedMsidata概述
HTML.	r script.	将TCGA肿瘤码映射到NCIT
PDF.		参考手册

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.12.0
在生物导体中以来	BIOC 3.7（R-3.5）（3年）
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 3.6.0），方法，utils
进口	ComplexHeatMap.那S4Vectors.那bigrquery.那闪亮的，统计，httr.那rjson.那dplyr.那Magrittr.， 网格，DT.那Genomicranges.那绞喉那ggplot2.那概括分析那DBI.那基因组法那CutatedTCGADATA.那秤那ggpubr.那普利尔那车那图形那rghrachviz
链接到
建议	kn那dbplyr.那org.hs.eg.db.那MultiAsaySayexperiment.那生物焦那ontoproc.那ontologyplot.那波音那Genomeinfodb.那休息（> = 1.3.7），biocfilecache.那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.那BioBase.那txdb.hsapiens.ucsc.hg18.knowngene.那重塑2.那testthat.那annotationdbi.那Fdb.infiniummethylation.hg19.那ensdb.hsapiens.v75.那RAMAMAMDOW.那RHDF5CLIEL.
系统要求
加强
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进口我
建议我
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包档案包

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源包	bioconcotk_1.12.0.tar.gz.
Windows二进制文件	bioconcotk_1.12.0.zip.（32-＆64位）
Macos 10.13（高塞拉）	bioconcotk_1.12.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocondudard.org/packages/bioconcotk.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/生物电键
包短网址	https://biocondion.org/packages/bioconcotk/
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