BiocSingular

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocSingular

生物导体封装的奇异值分解

生物导体版本:发布(3.13)

实现奇异值分解和主成分分析的精确和近似方法，在一个允许它们在Bioconductor包或工作流中容易切换的框架中。在可能的情况下，使用BiocParallel框架实现并行化。

作者:Aaron Lun [aut, cre, cph]

维护者:Aaron Lun

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("BiocSingular")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BiocSingular”)

超文本标记语言	R脚本	1.奇异值分解和主成分分析
超文本标记语言	R脚本	2.矩阵类
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文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	BiocGenerics，S4Vectors，矩阵、方法、跑龙套DelayedArray，BiocParallel，ScaledMatrix，irlba，rsvd，Rcpp，beachmat
链接	Rcpp，beachmat
建议	testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown，ResidualMatrix
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://github.com/LTLA/BiocSingular
BugReports	https://github.com/LTLA/BiocSingular/issues
取决于我	compartmap
进口我	后面;，BayesSpace，clusterExperiment，GSVA，miloR，mumosa，NewWave，PCAtools，嘘，scDblFinder，scMerge，食物，用水晶球占卜，单，伶盗龙
建议我	HCAData，ResidualMatrix，ScaledMatrix，飞溅
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	BiocSingular_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	BiocSingular_1.8.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	BiocSingular_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocSingular
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BiocSingular
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BiocSingular/
包下载报告	下载数据