Bioconductor版本:发行版(3.13)
艾伦脑科学研究所提供了RNA测序(RNA- seq)数据资源,用于研究与人类大脑发育有关的转录机制,即BrainSpan。BrainSABER是一个R包,通过生成两个数据集的动态相似热图,方便了用户数据与BrainSpan图集中发现的不同发展阶段和大脑结构的比较。它还为用户数据提供了一个自验证容器。
作者:Carrie Minette和Evgeni Radichev
维护人员:USD Biomedical Engineering
引用(从R中,输入引用(“BrainSABER”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("BrainSABER")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“BrainSABER”)
超文本标记语言 | R脚本 | BrainSABER |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 4.0),biomaRt,SummarizedExperiment |
进口 | data.table,文理学院、方法、S4Vectors跑龙套,BiocFileCache |
链接 | |
建议 | BiocStyle,ComplexHeatmap,fastcluster,的热图,knitr,情节 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | BrainSABER_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | BrainSABER_1.2.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | BrainSABER_1.2.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/BrainSABER |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BrainSABER |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/BrainSABER/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
文档»
Bioconductor
支持»
请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: