BrainSABER

DOI:10.18129 / B9.bioc.BrainSABER

生物基表达集R工具集中的脑跨度图谱

Bioconductor版本:发行版(3.13)

艾伦脑科学研究所提供了RNA测序(RNA- seq)数据资源,用于研究与人类大脑发育有关的转录机制,即BrainSpan。BrainSABER是一个R包,通过生成两个数据集的动态相似热图,方便了用户数据与BrainSpan图集中发现的不同发展阶段和大脑结构的比较。它还为用户数据提供了一个自验证容器。

作者:Carrie Minette和Evgeni Radichev

维护人员:USD Biomedical Engineering

引用(从R中,输入引用(“BrainSABER”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("BrainSABER")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“BrainSABER”)

超文本标记语言 R脚本 BrainSABER
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文本 新闻

细节

biocViews 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.2.0
在Bioconductor公司 BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.0),biomaRtSummarizedExperiment
进口 data.table文理学院、方法、S4Vectors跑龙套,BiocFileCache
链接
建议 BiocStyleComplexHeatmapfastcluster的热图knitr情节
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 BrainSABER_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 BrainSABER_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) BrainSABER_1.2.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/BrainSABER
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BrainSABER
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/BrainSABER/
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