cnanorm

doi:10.18129/b9.bioc.cnanorm

癌症样品中拷贝数像差的标准化方法

生物导体版本:版本(3.13)

执行比率,GC内容校正和使用低覆盖范围获得的数据的归一化(一读每100-10,000 bp)高槽测序。它执行了“离散”归一化,以寻找基因组的倍增感。如果至少发现两个倍态状态,它也将提供肿瘤含量。

作者:stefano berri ,亨利·伍德(Henry M. Wood)

维护者:Stefano Berri

引用(从r内,输入引用(“ cnanorm”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ cnanorm”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ cnanorm”)

PDF R脚本 cnanorm.pdf
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细节

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版本 1.38.0
在生物导体中 Bioc 2.9(R-2.14)(9。5年)
执照 GPL-2
要看 R(> = 2.10.1),方法
进口 DNACOPIGY
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 cnanorm_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 cnanorm_1.38.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) cnanorm_1.38.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cnanorm
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/cnanorm
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/cnanorm/
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