CNVPanelizer.

DOI：10.18129 / b9.bioc.cnvpanelizer

目标测序应用中可靠的CNV检测

Bioconductor版本：释放（3.13）

一种方法，其允许使用非匹配的正常组织样本的集合。我们的方法使用可用参考样本的非参考引导签证来应用来估计来自目标测序的读数的分布。由随机森林的启发，这与将与每个靶向基因相关的扩增子的过程相结合。所获得的信息允许我们可靠地对基因级别的拷贝数像差进行分类。

作者：Cristiano Oliveira [Aut]，Thomas Wolf [Aut，Cre]，Albrecht Stenzinger [CTB]，Volker Endris [CTB]，Nicole Pfarr [CTB]，Benedikt Brors [Ths]，Wilko Weichert [Ths]

维护者：Thomas Wolf

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squiatly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“cnvpanelizer”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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PDF.	r script.	CNVPanelizer.
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文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.24.0
在生物导体中以来	BIOC 3.2（R-3.2）（5.5岁）
执照	GPL-3
依靠	r（> = 3.2.0），Genomicranges.
进口	生物根系那S4Vectors.，grdevices，stats，utils，噪音那绞喉那RSAMTOOLS.那exoMecopy.那Foreach.那ggplot2.那普利尔那genomeinfodb.那贡献那重塑2.那stringr.那testthat.，图形，方法，闪亮的那Shinyfiles.那Shinyjs.， 网格，OpenXLSX.
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建议	kn那运行
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	cnvpanelizer_1.24.0.tar.gz.
Windows二进制文件	cnvpanelizer_1.24.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	cnvpanelizer_1.24.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/cnvpanelizer
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ Cnvpanelizer
包短网址	https://biocumon.org/packages/cnvpanelizer/
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