CNVRD2.

DOI：10.18129 / b9.bioc.cnvrd2.

CNVRD2：一种基于读取的深度的方法，用于从下一代测序数据中检测和基因型复合常用副本变体。

Bioconductor版本：释放（3.13）

CNVRD2使用下一代测序数据来测量多个样本的人类基因拷贝数，识别SNP标记拷贝数变体并检测拷贝数多态性基因组区域。

作者：Hoang Tan Nguyen，Tony R Merriman和Mik Black

维护者：Hoang Tan Nguyen

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“cnvrd2”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“CNVRD2”）

PDF.	r script.	带有knitr的酥皮鳞片
PDF.		参考手册

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.30.0.
在生物导体中以来	BIOC 2.13（R-3.0）（7.5岁）
执照	GPL-2
依靠	R（> = 3.0.0），方法，VariantAnnotation.， 平行，rjags.那ggplot2.那格拉底
进口	dnacopy.那绞喉那RSAMTOOLS.
链接到
建议	kn
系统要求
加强
URL.	https://github.com/hoangtn/cnvrd2.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	cnvrd2_1.30.0.tar.gz.
Windows二进制文件	cnvrd2_1.30.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	cnvrd2_1.30.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/cnvrd2.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ CNVRD2
包短网址	https://biocumon.org/packages/cnvrd2/
包裹下载报告	下载统计信息