CancerMutationAnalysis

DOI:10.18129 / B9.bioc.CancerMutationAnalysis

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癌症突变分析

Bioconductor版本:发行版(3.13)

该软件包实现了癌症体细胞突变研究的基因和基因集水平分析方法。基因水平的方法区分驱动基因(在肿瘤发生中起积极作用)和乘客基因(在肿瘤样本中突变，但在肿瘤发生中没有作用)，并纳入两阶段研究设计。基因集方法实现了一种面向患者的方法，该方法为每个样本计算基因集得分，然后在整个样本中组合它们;还提供了使用Wilcoxon检验的基因导向方法进行比较。

作者:乔瓦尼·帕尔玛吉亚尼，西米娜·m·博卡

维护者:Simina M. Boca

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("CancerMutationAnalysis")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.34.0
在Bioconductor	BioC 2.10 (R-2.15)(9年)
许可证	GPL(>= 2) +文件许可
取决于	R (>= 2.10.0)，qvalue
进口	AnnotationDbi，limma、方法、统计
链接
建议	KEGG.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CancerMutationAnalysis
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CancerMutationAnalysis
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CancerMutationAnalysis/
软件包下载报告	下载数据