cancersubtypes

doi:10.18129/b9.bioc.cancersubtypes

基于多个基因组数据集的癌症亚型识别,验证和可视化

生物导体版本:版本(3.15)

cancersubtypes整合了用于癌症亚型鉴定的当前常见计算生物学方法,并为基于癌症亚型分析的多摩变数据提供了标准化的框架,例如基因表达,miRNA表达,DNA甲基化等。

作者:Taosheng Xu [AUT,CRE]

维护者:taosheng xu

引用(从r内,输入引用(“ cancersubtypes”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ CancerSubTypes”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ cancersubtypes”)

html R脚本 cancersubtypes
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 1.22.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(5。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 4.0),sigclust,,,,NMF
进口 iCluster,,,,,,,,,,,,林玛,,,,共识ClusterPlus,grdevices,生存
链接
建议 生物基因,,,,尼特,,,,rtcga.mrna,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/taoshengxu/cancersubtypes
BugReports https://github.com/taoshengxu/cancersubtypes/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 cancersubtypes_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 cancersubtypes_1.22.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) cancersubtypes_1.22.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cancersubtypes
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/cancersubtypes
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/cancersubtypes/
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