CETF.

DOI：10.18129 / b9.bioc.cetf.

使用监管影响因素和部分相关性和信息理论分析的转录因子共表达

Bioconductor版本：释放（3.13）

该包提供了对信息理论（PCIT）（唤醒和陈2008）的部分相关系数进行部分相关系数的必要功能和监管影响因素（RIF）（RIF）（Reverter等，2010）算法。PCIT算法识别有意义的相关性，以定义加权网络中的边缘，并且可以应用于任何基于相关的网络，包括但不限于基因共表达网络，而RIF算法识别来自基因表达数据的关键转录因子（TF）。当组合时，这两种算法提供了基因表达研究的非常相关的信息层（微阵列，RNA-SEQ和单细胞RNA-SEQ数据）。

作者：Carlos Alberto Oliveira de Biagi Junior [Aut，Cre]，Ricardo Perecin Nociti [Aut]，Breno Osvaldo Funicheli [Aut]，JoãoPauloBianchiXimenez[CTB]，Marcelo Gomes De Paula [CTB]，Marcelo Gomes de Paula [CTB]]，Rafael Dos Santos Bezerra [CTB]，WilsonAraújoda Silva Junior [Aut，THS]

维护者：Carlos Alberto Oliveira de Biagi Junior

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“cetf”）

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HTML.	r script.	分析监管影响因素和部分相关性与信息理论
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Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.4.0.
在生物导体中以来	BIOC 3.11（R-4.0）（1年）
执照	GPL-3
依靠	r（> = 4.0），方法
进口	盘旋那ComplexHeatMap.那蜡笔那ClusterProfiler.那deseq2.那dplyr.那Genomictools.那Genomictools.FileHandler.那GGNetwork.那施说那ggplot2.那ggpubr.那GGRepel.，图形，grdevices，grid，iGraph.那网络那pbapply.那rcolorbrewer.那rcy3.那重塑2.那S4Vectors.那秤，统计，概括分析那Tidyr.，实用，WebGestaltr.
链接到
建议	呼吸道那kableextra.那kn那org.hs.eg.db.那RAMAMAMDOW.那testthat.
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
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包档案包

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源包	cetf_1.4.0.tar.gz.
Windows二进制文件	cetf_1.4.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	cetf_1.4.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/cetf.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ cetf
包短网址	https://biocumon.org/packages/cetf/
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