CellBench

DOI:10.18129 / B9.bioc.CellBench

构建单细胞分析方法的基准

Bioconductor版本:发行版(3.15)

这个包包含基准测试分析方法的基础设施和对单单元混合基准测试数据的访问。它为在管道中组织分析方法和测试方法组合提供了一个框架，而无需显式地布局每个组合。它还提供了采样和过滤singlecellexperexperiment对象、构造具有不同参数的函数列表以及分析方法的多线程求值的实用程序。

作者:shan Su [cre, aut]， Saskia Freytag [aut]， Luyi Tian [aut]，董学义[aut]， Matthew Ritchie [aut]， Peter Hickey [ctb]， Stuart Lee [ctb]

维护者:Shian Su < Su。年代在wehi.edu.au >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CellBench")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“CellBench”)

超文本标记语言		CellBenchCaseStudy.html
PDF	R脚本	数据操作
超文本标记语言	R脚本	简介
PDF	R脚本	Tidyverse模式
超文本标记语言	R脚本	时机
超文本标记语言	R脚本	编写包装
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (R-3.6)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.6),SingleCellExperiment，magrittr、方法、统计数据宠物猫,跑龙套
进口	BiocGenerics，BiocFileCache，BiocParallel，dplyr，rlang，胶水，memoise，purrr(> = 0.3.0),rappdirs，tidyr，tidyselect，lubridate
链接
建议	BiocStyle，covr，knitr，rmarkdown，testthat，limma，ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/shians/cellbench
BugReports	https://github.com/Shians/CellBench/issues
取决于我
进口我
建议我	科拉尔
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	CellBench_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	CellBench_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	CellBench_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CellBench
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CellBench
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CellBench/
包下载报告	下载数据