细胞索

doi：10.18129/b9.bioc.cellscore

从转录曲线评估细胞身份的工具

生物导体版本：版本（3.15）

CellScore软件包包含评估测试样品的细胞身份的功能，鉴于用启动（供体）细胞类型和所需目标细胞类型定义的细胞过渡。评估是基于一个评分系统，该系统使用一组已知单元类型的标准样本作为参考集。这些函数已从一个平台（Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0）上进行大量的微阵列数据进行。原则上，只要有足够数量的标准样本并将数据归一化，该方法就可以应用于任何表达数据集。

作者：Nancy Mah，Katerina Taskova

维护者：nancy mah

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ CellScore”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ CellScore”）

PDF	R脚本	r软件包：单元格
PDF		参考手册

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.16.0
在生物导体中	Bioc 3.7（R-3.5）（4年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 3.5.0）
进口	生物酶（> = 2.39.1），图形（> = 3.5.0），grdevices（> = 3.5.0），GPLOTS（> = 3.0.1），LSA（> = 0.73.1），方法（> = 3.5.0），rcolorbrewer（> = 1.1-2），壁球（> = 1.0.8），stats（> = 3.5.0），utils（> = 3.5.0）
链接
建议	HGU133PLUS2CELLSCORE，，，，尼特
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	CellScore_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	CellScore_1.16.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	CellScore_1.16.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellscore
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/cellscore
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/cellscore/
软件包下载报告	下载统计