CEPO

doi:10.18129/b9.bioc.cepo

CEPO鉴定差异稳定基因

生物导体版本:版本(3.15)

定义细胞的身份对于了解细胞对各种环境信号和扰动的异质性至关重要。我们提出了CEPO,这是一种使用差异稳定性作为定义细胞身份基因的新指标来探索单细胞RNA测序数据中细胞身份的新方法。CEPO计算与差异稳定基因表达有关的细胞类型特异性基因统计。

作者:Hani Jieun Kim [AUT,CRE],凯文·王[自动]

维护者:hani jieun kim

引用(从r内,输入引用(“ CEPO”)):

安装

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if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ CEPO”)

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html R脚本 CEPO方法用于SCRNA-SEQ数据的差异稳定性分析
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版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.14(R-4.1)(1年)
执照 麻省理工学院 +文件许可证
要看 gseabase,r(> = 4.1)
进口 延迟的matrixstats,,,,延迟,,,,HDF5Array,,,,S4VECTORS, 方法,Singlecellexperiment,,,,总结性特征,,,,GGPLOT2,,,,rlang,grdevices,拼布,,,,RESHAPE2,,,,生物比较,统计dplyr
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,测试,,,,COVR,,,,insctr,,,,评分,,,,Scmerge,,,,fgsea,,,,逃脱,,,,pheatmap,,,,拼布
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源包 cepo_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 cepo_1.2.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) cepo_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cepo
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/cepo
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/cepo/
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