生物导体版本:版本(3.15)
定义细胞的身份对于了解细胞对各种环境信号和扰动的异质性至关重要。我们提出了CEPO,这是一种使用差异稳定性作为定义细胞身份基因的新指标来探索单细胞RNA测序数据中细胞身份的新方法。CEPO计算与差异稳定基因表达有关的细胞类型特异性基因统计。
作者:Hani Jieun Kim [AUT,CRE],凯文·王[自动]
维护者:hani jieun kim
引用(从r内,输入引用(“ CEPO”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ CEPO”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ CEPO”)
html | R脚本 | CEPO方法用于SCRNA-SEQ数据的差异稳定性分析 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.2.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.14(R-4.1)(1年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件许可证 |
要看 | gseabase,r(> = 4.1) |
进口 | 延迟的matrixstats,,,,延迟,,,,HDF5Array,,,,S4VECTORS, 方法,Singlecellexperiment,,,,总结性特征,,,,GGPLOT2,,,,rlang,grdevices,拼布,,,,RESHAPE2,,,,生物比较,统计dplyr |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,测试,,,,COVR,,,,insctr,,,,评分,,,,Scmerge,,,,fgsea,,,,逃脱,,,,pheatmap,,,,拼布 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | ScClassify |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | cepo_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | cepo_1.2.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | cepo_1.2.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cepo |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/cepo |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/cepo/ |
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