cexor

doi:10.18129/b9.bioc.cexor

R包,以发现ChIP-EXO重复中的高分辨率蛋白-DNA相互作用

生物导体版本:版本(3.15)

CHIP-EXO中的特定峰值对重复。累积的Skellam分布函数用于检测每个DNA链(峰对)处的相对符号的显着归一化计数差异。然后,计算了跨生物学重复的重叠峰对的不可再现的发现率。

作者:Pedro Madrigal [AUT,CRE]

维护者:pedro madrigal

引用(从r内,输入引用(“ cexor”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ cexor”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ cexor”)

PDF R脚本 Cexor Vignette
PDF 参考手册
文本 执照

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 1.34.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(8。5年)
执照 Artistic-2.0 |GPL-2 +文件执照
要看 r(> = 4.0.0),S4VECTORS,,,,iranges
进口 rsamtools,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,rtracklayer,,,,IDR,,,,rcolorbrewer,,,,基因组化
链接
建议 运行,,,,生物基因,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 cexor_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 cexor_1.34.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) cexor_1.34.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cexor
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/cexor
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/cexor/
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