chipqc.

DOI：10.18129 / b9.bioc.chipqc

ChipSeq数据的质量指标

Biocometiond版本：释放（3.12）

ChipSeq数据的质量指标。

作者：汤姆卡罗尔，魏刘，伊斯州德斯圣地亚哥，罗里斯塔克

维护者：Gmail.com>汤姆卡罗尔

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“chipqc”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“CHIPQC”）

PDF.	r script.	使用CHIPQC评估芯片-SEQ样品质量
PDF.		chipqcsamplereport.pdf.
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.26.0
在生物导体中以来	BIOC 2.14（R-3.1）（7年）
执照	GPL（> = 3）
依靠	r（> = 3.0.0），ggplot2.那困惑那Genomicranges.（> = 1.17.19）
进口	生物根系（> = 0.11.3），S4Vectors.（> = 0.1.0），绞喉（> = 1.99.17），RSAMTOOLS.（> = 1.17.28），基因管理（> = 1.1.16），chipseq.（> = 1.12.0），GTOOLS.那生物相投， 方法，重塑2.那喷嘴那BioBase.，grdevices，stats，utils，基因组法那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.那txdb.hsapiens.ucsc.hg18.knowngene.那txdb.mmusculus.ucsc.mm10.knowngene.那txdb.mmusculus.ucsc.mm9.knowngene.那txdb.rnorvegicus.ucsc.rn4.ensgene.那txdb.celegans.ucsc.CE6.ensgene.那txdb.dmelanogaster.ucsc.dm3.ensgene.ensgene.
链接到
建议	生物焦
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	chipqc_1.26.0.tar.gz.
Windows二进制文件	chipqc_1.26.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	chipqc_1.26.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/chipqc.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/ chipqc
包短网址	https://biocumon.org/packages/chipqc/
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