芝加哥

DOI:10.18129 / B9.bioc.Chicago

芝加哥:基因组组织的高碳分析

生物导体版本:发布(3.13)

分析Capture Hi-C数据的管道。

作者:Jonathan Cairns, Paula Freire Pritchett, Steven Wingett, Mikhail Spivakov

维护者:米哈伊尔·斯比瓦科夫<米哈伊尔。在lms.mrc.ac.uk spivakov >

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install("Chicago")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“芝加哥”)

超文本标记语言	R脚本	芝加哥的故事
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (R-3.3)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.3.1),data.table
进口	matrixStats，质量，Hmisc，Delaporte，方法，grDevices，图形，统计，utils
链接
建议	argparse，BiocStyle，knitr，rmarkdown，PCHiCdata，testthat，Rsamtools，GenomicInteractions，GenomicRanges，IRanges，AnnotationHub
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	PCHiCdata
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	Chicago_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	Chicago_1.20.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	Chicago_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Chicago
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/芝加哥
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Chicago/
包下载报告	下载数据