Biocometiond版本:释放(3.12)
Chromscape - 用于单细胞的染色质景观分析 - 是一种用于分析单胞间表观焦元数据集(SCChip-SEQ,SCATAC-SEQ,SCCUT和TAG,SCCUT和TAG,SCCUT和TAG,SCCUT和TAG,SCCUT和TAG,SCCUT和TAG,...)的即可推出的用户友好的闪亮应用程序分析与基因集浓缩分析。它是高度互动的,使用户能够节省他们的分析并涵盖各种分析步骤:QC,预处理,过滤,批量校正,维度降低,Vizualation,聚类,差异分析和基因集分析。
作者:Pacome Prompsy [Aut,CRE],Celine vallot [aut]
维护者:Pacome Prompsy
引文(从R内,输入引文(“Chromscape”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
if(!perceneNamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“chromscape”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
Browsevignettes(“Chromscape”)
HTML. | r script. | Chromscape. |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
版本 | 1.0.0. |
在生物导体中以来 | BIOC 3.12(R-4.0)(<6个月) |
执照 | GPL-3 |
依靠 | r(> = 4.0) |
进口 | 闪亮的那Colourpicker.那Shinyjs.那rtracklayer.那Shinyfiles.那ShinyHelper.那Shinycssloaders.那矩阵那情节那Shinydashboard那托罗拉姆斯那kableextra.那viridis.那batchelor.那生物相投, 平行,RSAMTOOLS.那ggplot2.那齐那string那FS.那DT.那斯那撒尿那共识那RTSNE.那dplyr.那Tidyr.那Genomicranges.那绞喉那IRLBA.那rlist.那umap.那娇媚, 方法,雅思石那edger.,统计,图形,grdevices,utils,S4Vectors.那SinglecellexPeriment.那概括分析那msigdbr. |
链接到 | |
建议 | testthat.那kn那RAMAMAMDOW.那生物焦 |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | https://github.com/vallotlab/chromscape. |
Bugreports. | https://github.com/vallotlab/chromscape/issues. |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
源包 | chromscape_1.0.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | chromscape_1.0.0.zip. |
Macos 10.13(高塞拉) | chromscape_1.0.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/chromscape |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondudard.org:包装/丝景 |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/chromscape/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |