Citefuse

doi：10.18129/b9.bioc.citefuse

Citefuse：Cite-seq数据的多模式分析

生物导体版本：版本（3.13）

Citefuse Pacakage在预处理到集成分析（包括双重检测，基于网络的模态积分，细胞类型聚类，差异RNA和蛋白质表达分析，ADT评估，配体 - 体-受体相互作用的差异，配体RNA和蛋白质相互作用分析和基于互动网络的分析可视化。

作者：yingxin lin [AUT，CRE]，Hani Kim [aut]

维护者：yingxin lin

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ citefuse”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Citefuse”）

html	R脚本	Citefuse
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.4.0
在生物导体中	Bioc 3.11（R-4.0）（1年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 4.0）
进口	Singlecellexperiment（> = 1.8.0），总结性特征（> = 1.16.0），矩阵，，，，混音工具，，，，牛仔图，，，，GGPLOT2，，，，栅格， 网格，dbscan，，，，propr，，，，UWOT，，，，RTSNE，，，，S4VECTORS（> = 0.24.0），Igraph，，，，秤，，，，斯克兰（> = 1.14.6），图形，方法，统计，utils，RESHAPE2，，，，Ggridges，，，，Randomforest，，，，pheatmap，，，，ggraph，grdevices，RHDF5，，，，rlang
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，DT，，，，mclust，，，，评分，，，，博览会，，，，生物使用，，，，pkgdown
系统要求
增强
URL
BugReports	https://github.com/sydneybiox/citefuse/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	citefuse_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	citefuse_1.4.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	citefuse_1.4.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/citefuse
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/citefuse
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/citefuse/
软件包下载报告	下载统计