ClassifyR

DOI:10.18129 / B9.bioc.ClassifyR

交叉验证分类问题的框架,应用于差异可变性和差异分布测试

生物导体版本:发布(3.12)

该软件形式化了r中的分类框架。数据转换、特征选择、分类器训练和预测。变量类型和名称的要求是固定的,但是也可以提供专门用于函数的变量。分类框架被封装在一个驱动程序循环中,该驱动程序循环可重复执行许多交叉验证方案。微分表达式、微分变异性和微分分布的函数包括在内。用户可以通过创建到框架的接口来开发其他功能。

作者:Dario Strbenac, John Ormerod, Graham Mann, Jean Yang

维护者:Dario Strbenac < Dario。在sydney.edu.au strbenac >

引文(从R中输入引用(“ClassifyR”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace(“BiocManager”,quiet = TRUE)) install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“ClassifyR”)

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文档

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browseVignettes(“ClassifyR”)

超文本标记语言 R脚本 ClassifyR包简介
超文本标记语言 R脚本 示例:为k-NN分类器创建包装函数
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细节

biocViews 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本 2.10.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (R-3.1)(6.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R(>= 3.5.0),方法,S4Vectors(> = 0.18.0),MultiAssayExperiment(> = 1.6.0),BiocParallel
进口 locfit、网格跑龙套,plyr
链接
建议 limma,genefilter,刨边机,,Rmixmod,ggplot2(> = 3.0.0),gridExtra(> = 2.0.0),cowplot,BiocStyle,pamr,PoiClaClu,parathyroidSE,knitr,htmltools,gtable,尺度,e1071,rmarkdown,IRanges,randomForest,robustbase,glmnet,
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 ClassifyR_2.10.0.tar.gz
Windows二进制 ClassifyR_2.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) ClassifyR_2.10.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ClassifyR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ClassifyR
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/ClassifyR/
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