CluMSID

DOI:10.18129 / B9.bioc.CluMSID

MS2光谱在代谢物识别中的聚类研究

Bioconductor版本:发行版(3.15)

clusid是一种工具,通过使用MS2光谱相似性和无监督统计方法,帮助识别非靶向LC-MS/MS分析中的特征。它提供了从原始数据到可视化的完整和可定制工作流的功能,并可与xmcs预处理包家族进行接口。

作者:Tobias Depke [aut, cre], Raimo Franke [ctb], Mark Broenstrup [ths]

维护者:Tobias Depke < Depke at mailbox.org>

引用(从R中,输入引用(“CluMSID”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“CluMSID”)

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细节

biocViews 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.12.0
Bioconductor自 BioC 3.9 (R-3.6)(3.5年)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于 R (> = 3.6)
进口 mzRS4VectorsdbscanRColorBrewer网络GGallyggplot2情节,方法,utils,统计,系统网络体系结构(sna)grDevices图形,BiobasegplotsMSnbase
链接
建议 knitrrmarkdowntestthatdplyrreadrstringrmagrittrCluMSIDdatametaMSmetaMSdataxcms
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/tdepke/CluMSID
BugReports https://github.com/tdepke/CluMSID/issues
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 CluMSID_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 CluMSID_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) CluMSID_1.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CluMSID
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CluMSID
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/CluMSID/
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