Bioconductor版本:发行版(3.15)
clusid是一种工具,通过使用MS2光谱相似性和无监督统计方法,帮助识别非靶向LC-MS/MS分析中的特征。它提供了从原始数据到可视化的完整和可定制工作流的功能,并可与xmcs预处理包家族进行接口。
作者:Tobias Depke [aut, cre], Raimo Franke [ctb], Mark Broenstrup [ths]
维护者:Tobias Depke < Depke at mailbox.org>
引用(从R中,输入引用(“CluMSID”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“CluMSID”)
超文本标记语言 | R脚本 | CluMSID DI-MS / MS教程 |
超文本标记语言 | R脚本 | CluMSID GC-EI-MS教程 |
超文本标记语言 | R脚本 | CluMSID LowRes教程 |
超文本标记语言 | R脚本 | CluMSID MTBLS教程 |
超文本标记语言 | R脚本 | CluMSID教程 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.12.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.9 (R-3.6)(3.5年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | R (> = 3.6) |
进口 | mzR,S4Vectors,dbscan,RColorBrewer,猿,网络,GGally,ggplot2,情节,方法,utils,统计,系统网络体系结构(sna)grDevices图形,Biobase,gplots,MSnbase |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,testthat,dplyr,readr,stringr,magrittr,CluMSIDdata,metaMS,metaMSdata,xcms |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/tdepke/CluMSID |
BugReports | https://github.com/tdepke/CluMSID/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | CluMSID_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | CluMSID_1.12.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | CluMSID_1.12.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CluMSID |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CluMSID |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/CluMSID/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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Bioconductor
支持»
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