CoGAPS

DOI:10.18129 / B9.bioc.CoGAPS

模式集中的协调基因活动

Bioconductor版本:发行版(3.15)

协同基因活动模式集(cogap)实现了贝叶斯MCMC矩阵分解算法gap，并将其与基因集统计方法联系起来，以推断生物过程活性。它可以用于对任何数据进行稀疏矩阵分解，当该数据表示生物分子时，可以进行基因集分析。

作者:Thomas Sherman, Wai-shing Lee, Conor Kelton, Ondrej Maxian, Jacob Carey, Genevieve Stein-O'Brien, Michael Considine, Maggie Wodicka, John Stansfield, Shawn Sivy, Carlo Colantuoni, Alexander Favorov, Mike Ochs, Elana Fertig

维护者:Elana J. Fertig ， Thomas D. Sherman ， Jeanette Johnson

安装

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如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" cogap ")

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文档

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browseVignettes(“CoGAPS”)

超文本标记语言	R脚本	CoGAPS
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细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	3.16.0
Bioconductor自	BioC 2.7 (R-2.12)(11.5年)
许可证	BSD_3_clause +文件许可证
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	BiocParallel，集群、方法、gplots、图形、grDevicesRColorBrewer，Rcpp，S4Vectors，SingleCellExperiment统计数据,SummarizedExperiment、工具、跑龙套rhdf5
链接	Rcpp，黑洞
建议	testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	projectR
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	CoGAPS_3.16.0.tar.gz
Windows二进制	CoGAPS_3.16.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	CoGAPS_3.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CoGAPS
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CoGAPS
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CoGAPS/
包下载报告	下载数据