生物导体版本:发布(3.13)
CopyNumberPlots有一组扩展了核绘图器功能的函数,可以创建漂亮的、可定制的、灵活的copy-number相关数据图。
作者:Bernat Gel
维护人员:Bernat Gel
引文(从R中输入引用(“CopyNumberPlots”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!安装BiocManager::install("CopyNumberPlots")
有关较旧版本的R,请参阅适当的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“CopyNumberPlots”)
超文本标记语言 | R脚本 | CopyNumberPlots装饰图案 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.8.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.9 (R-3.6)(2年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.6),karyoploteR |
进口 | 地区,IRanges,Rsamtools,SummarizedExperiment,VariantAnnotation、方法、统计数据GenomeInfoDb,GenomicRanges,cn.mops,rhdf5,跑龙套 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,panelcn.mops,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked,DNAcopy,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/bernatgel/CopyNumberPlots |
BugReports | https://github.com/bernatgel/CopyNumberPlots/issues |
取决于我 | |
进口我 | CNVfilteR,CNViz |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | CopyNumberPlots_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | CopyNumberPlots_1.8.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | CopyNumberPlots_1.8.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CopyNumberPlots |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CopyNumberPlots |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/CopyNumberPlots/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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