CopyNumberPlots

DOI:10.18129 / B9.bioc.CopyNumberPlots

使用核绘图器功能创建拷贝编号图

生物导体版本:发布(3.13)

CopyNumberPlots有一组扩展了核绘图器功能的函数,可以创建漂亮的、可定制的、灵活的copy-number相关数据图。

作者:Bernat Gel

维护人员:Bernat Gel

引文(从R中输入引用(“CopyNumberPlots”)):

安装

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如果(!安装BiocManager::install("CopyNumberPlots")

有关较旧版本的R,请参阅适当的Bioconductor释放

文档

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browseVignettes(“CopyNumberPlots”)

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版本 1.8.0
Bioconductor自 BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.6),karyoploteR
进口 地区IRangesRsamtoolsSummarizedExperimentVariantAnnotation、方法、统计数据GenomeInfoDbGenomicRangescn.mopsrhdf5,跑龙套
链接
建议 BiocStyleknitrpanelcn.mopsBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.maskedDNAcopytestthat
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/bernatgel/CopyNumberPlots
BugReports https://github.com/bernatgel/CopyNumberPlots/issues
取决于我
进口我 CNVfilteRCNViz
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 CopyNumberPlots_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 CopyNumberPlots_1.8.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) CopyNumberPlots_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CopyNumberPlots
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CopyNumberPlots
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/CopyNumberPlots/
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  • Bioc-devel邮件列表-为包开发人员2021欧洲杯体育投注开户