撰稿人

DOI：10.18129 / b9.bioc.copywriter.

使用偏离目标读取从有针对性测序复制编号信息

Bioconductor版本：释放（3.13）

CopyWriter通过Utiizing Off-Target读取从有针对性测序中提取DNA拷贝数信息。它允许提取均匀分布的拷贝数信息，可以在不参考的情况下使用，并且可以应用于从各种技术获得的测序数据，包括染色质免疫沉淀和靶向小基因面板的靶向富集。因此，CopyWriter构成可用副本号检测工具的广泛适用的替代方案。

作者：Thomas Kuilman

维护者：Oscar Krijgsman

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“撰稿人”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	2.24.0
在生物导体中以来	BIOC 3.1（R-3.2）（6年）
执照	GPL-2
依靠	r（> = 3.2），生物相投
进口	MatrixStats.那GTOOLS.那data.table.那S4Vectors.那chipseq.那绞喉那RSAMTOOLS.那dnacopy.那基因管理那Genomicranges.那CopyHelper.那genomeinfodb.那徒劳。霍尔格
链接到
建议	生物焦那sclcbam.那雪
系统要求
加强
URL.	https://github.com/peeperlab/copywriter.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	copyWriter_2.24.0.tar.gz.
Windows二进制文件	copyWriter_2.24.0.zip.（32-＆64位）
Macos 10.13（高塞拉）	copyWriter_2.24.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/copywriter.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/撰稿人
包短网址	https://biocumon.org/packages/copywriter/
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