CrossICC

DOI:10.18129 / B9.bioc.CrossICC

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面向多平台数据分析的交互式共识聚类框架

Bioconductor版本:发行版(3.13)

CrossICC采用迭代策略，从共识聚类生成的共识相似矩阵中得到最优基因集和簇数，能够处理多个跨平台数据集，不需要数据集之间的归一化。该软件包还提供了丰富的可视化和识别癌症亚型的功能。特别是，许多癌症相关的分析方法被嵌入，以促进已确定的癌症亚型的临床翻译。

作者:孙宇，赵琪

维护人员:孙宇

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("CrossICC")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(1.5年)
许可证	GPL-3 |文件LICENSE
取决于	R (>= 3.5)，质量
进口	data.table，方法，MergeMaid，ConsensusClusterPlus，limma，集群，dplyr，Biobase， grDevices，统计，图形，utils
链接
建议	rmarkdown，testthat，knitr，闪亮的，shinydashboard，shinyWidgets，shinycssloaders，DT，ggthemes，ggplot2，pheatmap，RColorBrewer，宠物猫，ggalluvial
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CrossICC
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CrossICC
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CrossICC/
软件包下载报告	下载数据