CytoTree

DOI:10.18129 / B9.bioc.CytoTree

流式和细胞术数据的工具包

Bioconductor版本:发行版(3.12)

一个用于流式细胞术和巨细胞术数据的轨迹推断工具包。细胞树是一个有价值的工具，建立树形轨迹使用流量和细胞计数数据。CytoTree的应用范围从聚类和降维到轨迹重建和伪时间估计。它提供了完整的流式和细胞术数据分析工作流程。

作者:戴玉婷[aut, cre]

维护人员:戴玉婷

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CytoTree")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“CytoTree”)

超文本标记语言	R脚本	Quick_start
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细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.0.3
在Bioconductor公司	BioC 3.12 (R-4.0)(< 6个月)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.0)，igraph
进口	FlowSOM，Rtsne，ggplot2，命运，gmodels，flowUtils，Biobase，矩阵，flowCore，股东价值分析，matrixStats、方法、mclust，prettydoc，RANN(> = 2.5),Rcpp(> = 0.12.0),BiocNeighbors，集群，pheatmap，scatterpie，umap，scatterplot3d，limma，stringr， grDevices，网格，统计
链接	Rcpp
建议	BiocGenerics，knitr，RColorBrewer，rmarkdown，testthat，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.r-project.orghttps://github.com/JhuangLab/CytoTree
BugReports	https://github.com/JhuangLab/CytoTree/issues
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	CytoTree_1.0.3.tar.gz
Windows二进制	CytoTree_1.0.3.zip(32- & 64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	CytoTree_1.0.3.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/CytoTree
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CytoTree
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CytoTree/
软件包下载报告	下载数据
bioc3.12的旧源包	源存档