- 家
- Biocumon 3.13
- 软件包
- DAMEFINDER.
DAMEFINDER.
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DOI：10.18129 / b9.bioc.damefinder.
找到含压型 - 差分等位基甲基化地区
Bioconductor版本：释放（3.13）
'DAMEFINDER'提供乘坐筛选或BISMARK输出的功能，以计算ASM分数和计算损坏。它还提供良好的甲基圆形图可视化。
作者：Stephany Orjuela [Aut，CRE]
，Dania Machlab [Aut]，Mark Robinson [Aut]
维护者：Stephany Orjuela
引文（从R内，输入引文（“DAMEFINDER”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：
if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“damefinder”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
BROWSEVIGNETTES（“DAMEFINDER”）
| HTML. | r script. | DAMEFINDER工作流程 |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
| 版本 | 1.4.0. |
| 在生物导体中以来 | BIOC 3.11（R-4.0）（1年） |
| 执照 | mit +文件执照 |
| 依靠 | r（> = 4.0） |
| 进口 | 统计数据，Genomeinfodb.那Genomicranges.那绞喉那S4Vectors.那读书那概括分析那基因管理那stringr.那普利尔那VariantAnnotation.， 平行，ggplot2.那RSAMTOOLS.那生物根系， 方法，林马那Bumphunter.那生物仪器那重塑2.那电台，实用程序 |
| 链接到 | |
| 建议 | 生物焦那kn那RAMAMAMDOW.那testthat.那rtracklayer.那bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19. |
| 系统要求 | |
| 加强 | |
| URL. | |
| Bugreports. | https://github.com/markrobinsonuzh/damefinder/issues. |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | damefinder_1.4.0.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | damefinder_1.4.0.zip.（32-＆64位） |
| Macos 10.13（高塞拉） | damefinder_1.4.0.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/damefinder. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondudard.org：包/ damefinder |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/damefinder/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
