DMRFORWAIRS.

DOI:10.18129 / b9.bioc.dmrfor脚步

DMRFORWAIRS:使用基于阵列的甲基化型材在独特样品之间识别差异甲基化区域

Bioconductor版本:释放(3.13)

DMRFORPAIRS(以前的DMR2 +)允许研究人员在其甲基化型材方面比较N> = 2个独特的样本。n个独特单个样本的(成对)比较区分DMRFORPAIRS与其他现有管道的DMRFORPAIRS在这些通常比较单个CPG轨迹或基于区域的分析中的样本组。DMRFORPAIRS将兴趣区域定义为基因组范围,具有足够的探针彼此靠近的探针。一个区域中的探针可选地向相同的功能类注释。通过将各个样品之间的每个区域内的甲基化值与(如果差异足够大)进行评价差分甲基化,以统计显着性地测试这种差异。

作者:Martin Rijlaarsdam [Aut,Cre],Yvonne VD Zwan [Aut],Lambert Dorssers [Aut],Leendert Looijenga [Aut]

维护者:Martin Rijlaarsdam

引文(从R内,输入引文(“DMRFORPAIRS”)):

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if(!procennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“dmrforpaes”)

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版本 1.28.0.
在生物导体中以来 BIOC 2.14(R-3.1)(7年)
执照 GPL(> = 2)
依靠 r(> = 2.15.2),GVIZ.(> = 1.2.1),R2HTML(> = 2.2.1),Genomicranges.(> = 1.10.7),并行
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源包 dmrforpaess_1.28.0.tar.gz.
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源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/dmrforware.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包装/ dmrfor脚
包短网址 https://biocumon.org/packages/dmrforpaess/
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