Bioconductor版本:释放(3.13)
DMRFORPAIRS(以前的DMR2 +)允许研究人员在其甲基化型材方面比较N> = 2个独特的样本。n个独特单个样本的(成对)比较区分DMRFORPAIRS与其他现有管道的DMRFORPAIRS在这些通常比较单个CPG轨迹或基于区域的分析中的样本组。DMRFORPAIRS将兴趣区域定义为基因组范围,具有足够的探针彼此靠近的探针。一个区域中的探针可选地向相同的功能类注释。通过将各个样品之间的每个区域内的甲基化值与(如果差异足够大)进行评价差分甲基化,以统计显着性地测试这种差异。
作者:Martin Rijlaarsdam [Aut,Cre],Yvonne VD Zwan [Aut],Lambert Dorssers [Aut],Leendert Looijenga [Aut]
维护者:Martin Rijlaarsdam
引文(从R内,输入引文(“DMRFORPAIRS”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
if(!procennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“dmrforpaes”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“DMRFORPAIRS”)
PDF. | r script. | dmrforpaess_vignette. |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
版本 | 1.28.0. |
在生物导体中以来 | BIOC 2.14(R-3.1)(7年) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | r(> = 2.15.2),GVIZ.(> = 1.2.1),R2HTML(> = 2.2.1),Genomicranges.(> = 1.10.7),并行 |
进口 | |
链接到 | |
建议 | |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | http://www.martinrijlaarsdam.nl.http://www.erasmusmc.nl/pathologie/research/lepo/3898639/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
源包 | dmrforpaess_1.28.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | dmrforpaess_1.28.0.zip. |
Macos 10.13(高塞拉) | dmrforpaess_1.28.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/dmrforware. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondion.org:包装/ dmrfor脚 |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/dmrforpaess/ |
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