Bioconductor版本:释放(3.13)
实现循环二进制分割(CBS)算法进行分段DNA拷贝数数据,并识别具有异常拷贝数的基因组区域。
作者:Venkatraman E. Seshan,Adam Olshen
维护者:Venkatraman E. Seshan
引文(从R内,输入引文(“dnacopy”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
if(!properenamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“dnacopy”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“DNACOPY”)
PDF. | r script. | dnacopy. |
PDF. | 参考手册 |
Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
版本 | 1.66.0. |
在生物导体中以来 | BIOC 1.6(R-2.1)或更早(> 16年) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | |
进口 | |
链接到 | |
建议 | |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | CGHCALL.那CGHMCR.那克隆性那毒品那pur |
进口我 | AdacGH2.那Anufinder.那冠军那cn.farms.那cnanorm.那CNVRD2.那cont那骗子那撰稿人那Gwastools.那MDTS.那冰雹那Methcp.那最小值那QDNASEQ.那rcgh.那repitools.那范围那芝麻那snapcgh. |
建议我 | beadarraysnp.那cn.mops.那CopyNumberplots.那快速那Genoset. |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
源包 | dnacopy_1.66.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | dnacopy_1.66.0.zip. |
Macos 10.13(高塞拉) | dnacopy_1.66.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/dnacopy. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondudard.org:包装/ dnacopy |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/dnacopy/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |