dnacopy.

DOI:10.18129 / b9.bioc.dnacopy.

DNA拷贝数数据分析

Bioconductor版本:释放(3.13)

实现循环二进制分割(CBS)算法进行分段DNA拷贝数数据,并识别具有异常拷贝数的基因组区域。

作者:Venkatraman E. Seshan,Adam Olshen

维护者:Venkatraman E. Seshan

引文(从R内,输入引文(“dnacopy”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!properenamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“dnacopy”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“DNACOPY”)

PDF. r script. dnacopy.
PDF. 参考手册

细节

Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.66.0.
在生物导体中以来 BIOC 1.6(R-2.1)或更早(> 16年)
执照 GPL(> = 2)
依靠
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取决于我 CGHCALL.CGHMCR.克隆性毒品pur
进口我 AdacGH2.Anufinder.冠军cn.farms.cnanorm.CNVRD2.cont骗子撰稿人Gwastools.MDTS.冰雹Methcp.最小值QDNASEQ.rcgh.repitools.范围芝麻snapcgh.
建议我 beadarraysnp.cn.mops.CopyNumberplots.快速Genoset.
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 dnacopy_1.66.0.tar.gz.
Windows二进制文件 dnacopy_1.66.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) dnacopy_1.66.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/dnacopy.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包装/ dnacopy
包短网址 https://biocumon.org/packages/dnacopy/
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