德里姆瑟克

DOI：10.18129 / b9.bioc.drimseq.

使用RNA-SEQ的Dirichlet-Multimalial模型分析差分转录物使用和TUQTL

Biocometiond版本：释放（3.12）

该包提供了两个框架。一个用于不同条件和一个用于TUQTL分析之间的差分转录物的使用分析。两者都是基于利用Dirichlet-Multimalial分布建模基因组特征（即转录物）的计数。该包还可以提供可视化和探索数据和结果的功能。

作者：Malgorzata Nowicka [Aut，Cre]

维护者：Malgorzata Nowicka

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“drimseq”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“DRIMSEQ”）

PDF.	r script.	使用DRIMSeq包在RNA-SEQ中分析差分转录物使用和转录物使用QTL
PDF.		参考手册
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细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.18.0
在生物导体中以来	BIOC 3.3（R-3.3）（4.5岁）
执照	GPL（> = 3）
依靠	r（> = 3.4.0）
进口	utils，stats，大量的那Genomicranges.那绞喉那S4Vectors.那生物根系， 方法，生物相投那林马那edger.那ggplot2.那重塑2.
链接到
建议	pasillatranscriptexpr.那geuvadistranscriptexpr.， 网格，生物焦那kn那testthat.
系统要求
加强
URL.
取决于我	rnaseqdtu.
进口我	匪徒那IsoformSwitchAnalyzer.
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	drimseq_1.18.0.tar.gz.
Windows二进制文件	drimseq_1.18.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	DRIMSEQ_1.18.0.TGZ.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/drimseq.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包/德里姆塞克
包短网址	https://biocumon.org/packages/drimseq/
包裹下载报告	下载统计信息