DSS.

DOI：10.18129 / b9.bioc.dss.

测序数据的分散收缩

Biocometiond版本：释放（3.12）

DSS是对基于计数的测序数据执行差异分析的R库。它检测来自RNA-SEQ的差异表达基因（DEGS），以及来自亚硫酸氢盐测序（BS-SEQ）的差异甲基化基因座或区（DML / DMR）。DSS的核心是一种新的分散收缩方法，用于估计来自伽马泊松或β-二项分子分布的分散参数。

作者：Hao Wu ，Hao Feng

维护者：Hao Wu ，Hao Feng

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“DSS”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“DS​​S”）

HTML.	r script.	DSS用户指南
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	2.38.0
在生物导体中以来	BIOC 2.11（R-2.15）（8.5岁）
执照	GPL.
依靠	R（> = 3.3），方法，BioBase.那生物相投那BSSeq.
进口	Utils，图形，统计数据，样条曲线，delayedarray
链接到
建议	生物焦那kn那RAMAMAMDOW.
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我	dmrcate.那kissde.那METASEQR2.那Methcp.那甲基氏
建议我	Biscuiteer.那methrix.那nanomethviz那恰当的
链接给我
建立报告

包档案包

跟随安装在r会话中使用此包的说明。

源包	dss_2.38.0.tar.gz.
Windows二进制文件	dss_2.38.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	dss_2.38.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/dss.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ DSS
包短网址	https://biocumon.org/packages/dss/
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