DeconRNASeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.DeconRNASeq

反褶积mRNA-Seq异构组织样本的数据

Bioconductor版本:版本(3.16)

DeconSeq R包反褶积的异构组织基于mRNA-Seq数据。从异构建模表达水平细胞种群mRNA-Seq加权平均的表达式不同构成的细胞类型和预测细胞类型比例的单一的表达谱。

作者:Ting锣< tinggong gmail.com >约瑟夫·d·Szustakowski <约瑟夫。在novartis.com szustakowski >

维修工:Ting锣< tinggong gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DeconRNASeq”)

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文档

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PDF	R脚本	DeconRNASeq演示
PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	1.40.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(10年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 2.14.0),limSolve,pcaMethods,ggplot2、网格
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	适应
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	DeconRNASeq_1.40.0.tar.gz
Windows二进制	DeconRNASeq_1.40.0.zip
macOS二进制(x86_64)	DeconRNASeq_1.40.0.tgz
macOS二进制(arm64)	DeconRNASeq_1.39.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DeconRNASeq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DeconRNASeq
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/DeconRNASeq/
包下载报告	下载数据