delayedarray

DOI：10.18129 / b9.bioc.delayedarray

统一的框架，用于透明地使用磁盘和内存阵列类似的数据集

Biocometiond版本：释放（3.12）

在delayedArray对象中包装阵列类似的对象（通常是磁盘对象）允许一个在不加载内存中的对象的情况下对其执行公共阵列操作。为了减少内存使用率和优化性能，使用块处理机制延迟或执行对象上的操作。请注意，这也适用于与DataFrame对象（通常使用RLE列），矩阵对象，普通数组和数据帧等内存阵列的对象工作。

作者：HervéPagès上，来自Peter Hickey 和Aaron Lun

维护者：HervéPagès

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“delayedarray”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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BROWSEVIGNETTES（“DELAYDARRAY”）

HTML.		实施DelayedArray后端
PDF.	r script.	使用r中的大阵列
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	0.16.3
在生物导体中以来	BIOC 3.5（R-3.4）（4年）
执照	艺术-2.0
依靠	R（> = 3.4），方法，stats4，矩阵那生物根系（> = 0.31.5），MatrixGenerics.（> = 1.1.3），S4Vectors.（> = 0.27.2），绞喉（> = 2.17.3）
进口	统计
链接到	S4Vectors.
建议	生物相投那HDF5Array.（> = 1.17.12），Genefilter.那概括分析那呼吸道那椒盐粉那delayedmatrixstats那kn那生物焦那运行
系统要求
加强
URL.	https://biocumon.org/packages/delayedarray.
Bugreports.	https://github.com/biococtor/delayedarray/issues.
取决于我	delayeddataframe.那delayedmatrixstats那GDSARRAY.那HDF5Array.那休息那RHDF5CLIEL.那singlecelltk.那Tiledbarray.那vcfarray.
进口我	batchelor.那海滩日那重音那生物贴眼那BSSeq.那蛋糕那Celaref.那celda.那celldex.那丁浓缩那descan2.那Dropletuls.那DSS.那埃尔默那弗雷泽那genogam.那基因组织那glmgampoi.那格拉姆4R.那Hipathia.那索细那MBKmeans.那methreg.那methrix.那甲基氏那Minfi.那MOFA2.那netsmooth.那新浪潮那pcatools.那Residualmatrix.那rtcgatoolbox.那撒尿那scdblfinder.那骗子那抚慰那SCPCA.那斯那斯克里那sc那签名探索那单歌者那概括分析那TSCan.那variantexperiment.那Velociraptor.那Weitrix.那Zellkonverter.
建议我	生物根系那Chippeakanno.那Gwascat那我懂了那桅杆那S4Vectors.那sqldataframe.
链接给我
建立报告

包档案包

跟随安装在r会话中使用此包的说明。

源包	delayedarray_0.16.3.tar.gz.
Windows二进制文件	delayedarray_0.16.3.zip.（32-＆64位）
Macos 10.13（高塞拉）	delayedarray_0.16.3.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/delayedarray.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ delayedarray
包短网址	https://biocumon.org/packages/delayedarray/
包裹下载报告	下载统计信息
BIOC 3.12的旧源包	源档案