差异调节

doi：10.18129/b9.bioc.differenceRegulation

从scrna-seq数据差异调节基因

生物导体版本：版本（3.15）

差异调节是一种通过靶向从单细胞RNA-RNA-RNA-RNA-RNA-RNA-获得的差异来检测两组样品之间（例如，健康与疾病或未经处理的样品与未经处理的样品与未经处理的样品）之间差异调节基因的方法。测序（SCRNA-SEQ）数据。差异调节解释了样本对样本的变异性，并将多个样品嵌入贝叶斯分层模型中。特别是，当读取与基因的多个基因或多个剪接版本兼容时，该方法将这些多映射读数分配给原点及其剪接版本。参数是通过马尔可夫链蒙特卡洛（MCMC）技术推断的参数（大都会 - 吉布斯）。

作者：Simone Tiberi [AUT，CRE]

维护者：Simone Tiberi

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ dindialialRegulation”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

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html	R脚本	差异调节
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细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.0.7
在生物导体中	Bioc 3.15（R-4.2）（<6个月）
执照	GPL-3
要看	R（> = 4.2.0）
进口	方法，RCPP，，，，Dorng，，，，大量的，，，，Data.Table，，，，多帕尔， 平行，foreach，统计土匪，，，，矩阵，，，，Singlecellexperiment，，，，总结性特征，，，，GGPLOT2
链接	RCPP，，，，rcpparmadillo
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，生物使用
系统要求	C ++ 11
增强
URL	https://github.com/simonetiberi/differentialRegulation
BugReports	https://github.com/simonetiberi/differentialRegulation/issues
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	dinialialRegulation_1.0.7.ta​​r.gz
Windows二进制	dinialialRegulation_1.0.7.zip
MacOS 10.13（高山脉）	dinialialRegulation_1.0.7.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/differentialRegulation
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/差异调制
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/differentialRegulation/
软件包下载报告	下载统计
Bioc 3.15的旧源软件包	来源存档