埃达

DOI:10.18129 / B9.bioc.EDDA

差异丰度分析的实验设计

Bioconductor版本:发行版(3.12)

EDDA可以帮助设计一系列常见的实验,如RNA-seq、纳米串分析、RIP-seq和宏基因组测序,并使研究人员能够全面研究实验决策对检测差异丰度能力的影响。这项工作发表在2014年12月3日的Genome Biology上,标题为“高通量实验中检测差异丰富特征的研究设计的重要性”(http://genomebiology.com/2014/15/12/527)。

作者:李俊涛,罗怀恩,Chia Kuan Hui Burton, Niranjan Nagarajan

维护者:Chia Kuan Hui Burton , Niranjan Nagarajan

引文(从R内,输入引用(“埃达”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("EDDA")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

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版本 1.28.0
在Bioconductor BioC 2.14 (R-3.1)(7年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 Rcpp(>= 0.10.4),并行,方法,ROCRDESeqbaySeq刨边机
进口 图形,统计,utils,并行,方法,ROCRDESeqbaySeq刨边机
链接 Rcpp
建议
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增强了
URL http://edda.gis.a-star.edu.sg/http://genomebiology.com/2014/15/12/527
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包档案

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源包 EDDA_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 EDDA_1.28.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) EDDA_1.28.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EDDA
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/EDDA
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/EDDA/
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