EGSEA

DOI:10.18129 / B9.bioc.EGSEA

基因集合富集分析集成

生物导体版本:发布(3.12)

该软件包实现了用于基因集测试的集成基因集富集分析(EGSEA)方法。

作者:母亲Alhamdoosh, Luyi Tian, Milica Ng和Matthew Ritchie

维护者:母亲Alhamdoosh

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace(“BiocManager”，quiet = TRUE)) install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“EGSEA”)

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“EGSEA”)

PDF	R脚本	EGSEA装饰图案
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文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.18.1
Bioconductor自	BioC 3.3 (R-3.3)(4.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5),Biobase，计(> = 2.14.4),AnnotationDbi，topGO(> = 2.16.0),pathview(> = 1.4.2)
进口	PADOG(> = 1.6.0),GSVA(> = 1.12.0),globaltest(> = 5.18.0),limma(> = 3.20.9),刨边机(> = 3.6.8),HTMLUtils(> = 0.1.5),hwriter(> = 1.2.2),gplots(> = 2.14.2),ggplot2(> = 1.0.0),安全(> = 3.4.0),stringi(>= 0.5.0)， parallel, stats，metap、grDevices、graphics、utils、org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，org.Rn.eg.db，RColorBrewer、方法、EGSEAdata(> = 1.3.1),Glimma(> = 1.4.0),htmlwidgets，情节，DT
链接
建议	BiocStyle，knitr，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	EGSEA123
进口我
建议我	EGSEAdata
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	EGSEA_1.18.1.tar.gz
Windows二进制	EGSEA_1.18.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	EGSEA_1.18.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EGSEA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ EGSEA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/EGSEA/
包下载报告	下载数据
BioC 3.12的旧源包	源存档