ENCODExplorer

DOI:10.18129 / B9.bioc.ENCODExplorer

ENCODE元数据的编译

生物导体版本:发布(3.13)

这个包允许用户快速访问ENCODE项目文件元数据，并允许访问helper函数来查询ENCODE rest api，下载ENCODE数据集，并以SQLite格式保存数据库。

作者:查尔斯·乔利·波帕朗<查尔斯。在crchul.ulaval.ca joly-beauparlant >，Audrey Lemacon , Eric Fournier , Louis Gendron , Astrid-Louise Deschenes , Arnaud Droit

维护者:查尔斯·乔利·波帕朗<查尔斯。在crchul.ulaval.ca joly-beauparlant >

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" encoexplorer ")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	2.18.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (R-3.2)(6年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.6)
进口	方法、工具jsonlite，RCurl，tidyr，data.table，dplyr，stringr，stringi跑龙套,AnnotationHub，GenomicRanges，rtracklayer，S4Vectors，GenomeInfoDb，ENCODExplorerData
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，knitr，旋度，httr，闪亮的，shinythemes，DT
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/CharlesJB/ENCODExplorer/issues
取决于我
进口我
建议我	TSRchitect
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ENCODExplorer
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ENCODExplorer
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ENCODExplorer/
包下载报告	下载数据