EnrichedHeatmap

DOI:10.18129 / B9.bioc.EnrichedHeatmap

制作丰富的热图

Bioconductor版本:发行版(3.13)

富集热图是一种特殊类型的热图,它可以可视化地显示特定目标区域上基因组信号的富集。这里我们通过ComplexHeatmap包实现了丰富的热图。由于这种类型的热图只是一个普通的热图,但有一些特殊的设置,使用ComplexHeatmap的功能,自定义热图以及连接到热图列表以显示不同数据源之间的对应关系会容易得多。

作者:顾祖光

维护者:祖光谷

引文(从R内,输入引用(“EnrichedHeatmap”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“EnrichedHeatmap”)

超文本标记语言 R脚本 1.制作丰富的热图
超文本标记语言 R脚本 2.可视化分类信号
超文本标记语言 R脚本 3.比较行排序方法
超文本标记语言 R脚本 4.在路线图数据集中可视化综合关联
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.22.0
在Bioconductor BioC 3.2 (R-3.2)(5.5年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R(>= 3.1.2),方法,网格,ComplexHeatmap(> = 2.5.1),GenomicRanges
进口 matrixStats统计数据,GetoptLongRcpp跑龙套,locfitcirclize(> = 0.4.5),IRanges
链接 Rcpp
建议 testthat(> = 0.3),knitr减价genefilterRColorBrewer
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/jokergoo/EnrichedHeatmap
全靠我
进口我 profileplyr
建议我 ComplexHeatmapInteractiveComplexHeatmap
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 EnrichedHeatmap_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 EnrichedHeatmap_1.22.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) EnrichedHeatmap_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EnrichedHeatmap
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/EnrichedHeatmap
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/EnrichedHeatmap/
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