繁殖

doi：10.18129/b9.bioc.pepidish

样品内杂质素的表观遗传解剖

生物导体版本：版本（3.15）

Epidish是一个R包，用于推断出代表此类细胞类型混合物的样品中存在的先验已知细胞类型的比例。目前，该包装可以用于全血，通用上皮组织和乳房组织的DNAN数据。此外，该软件包提供了一个函数，该功能允许鉴定差异甲基化的细胞类型及其在表观基因组范围的关联研究中的变化方向。

作者：Andrew E. Teschendorff [aut]，Shijie C. Zheng [AUT，CRE]

维护者：shijie C. Zheng

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Epidish”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Epidish”）

html	R脚本	样品内杂质素的表观遗传解剖
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	2.12.0
在生物导体中	Bioc 3.6（R-3.4）（4。5年）
执照	GPL-2
要看	R（> = 4.1）
进口	大量的，，，，E1071，，，，Quadprog，并行，统计，矩阵，，，，Stringr，，，，locfdr，，，，矩阵
链接
建议	roxygen2，，，，地球，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物酶，，，，测试
系统要求
增强
URL	https://github.com/sjczheng/epidish
BugReports	https://github.com/sjczheng/epidish/issues
取决于我	吐司
进口我
建议我	flowsorted.blood.epic，，，，行星
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	epidish_2.12.0.tar.gz
Windows二进制	epidish_2.12.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	epidish_2.12.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epidish
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/流行
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/epidish/
软件包下载报告	下载统计