FASTQCLEANER.

DOI:10.18129 / b9.bioc.fastqcleaner.

FASTQ文件的质量控制,过滤和修剪的闪亮应用

Bioconductor版本:释放(3.13)

FASTQ文件的质量控制,过滤和修剪的交互式Web应用程序。该用户友好的工具基于生物系统和缩小基础设施的数据处理,具有尖端可视环境。可以本地处理单读和配对结束文件。为输入和输出文件提供诊断交互式图(CG内容,每个基本序列质量等)。

作者:Leandro Roser [Aut,Cre],FernánAgüero[Aut],DanielSánchez[Aut]

维护者:Leandro Roser

引文(从R内,输入引文(“FASTQCLEANER”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“fastqcleaner”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“FASTQCLEANER”)

PDF. r script. FastQcleaner介绍
PDF. 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.10.0.
在生物导体中以来 BIOC 3.8(R-3.5)(2.5岁)
执照 mit +文件执照
依靠
进口 方法,闪亮的,统计,绞喉生物仪器缩短DT.S4Vectors.,图形,htmltools.Shinybs.rcpp.(> = 0.12.12)
链接到 rcpp.
建议 生物焦testthat.knRAMAMAMDOW.
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 FASTQCLEANER_1.10.0.TAR.GZ.
Windows二进制文件 fastqcleaner_1.10.0.0.zip.(32-&64位)
Macos 10.13(高塞拉) FASTQCLEANER_1.10.0.0.TGZ.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/fastqcleaner.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ FastQcleaner
包短网址 https://biocumon.org/packages/fastqcleaner/
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