生物导体版本:版本(3.15)
Flowsom通过使用自组织的地图聚类和最小的跨越树提供可视化选项,以提供细胞术数据的可视化选项。
作者:Sofie Van Gassen [AUT,CRE],Artuur Couckuyt [AUT],Katrien Quintelier [AUT],Annelies Emmaneel [Aut],Britt Callebaut [aut],Yvan Saeys [aut]
维护者:sofie van gassen
引用(从r内,输入引用(“流”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ flowsom”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“流”)
R脚本 | 流动 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 |
版本 | 2.4.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(7年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 4.0),Igraph |
进口 | 统计,utils,生物基因,,,,柱面,,,,共识ClusterPlus,,,,细胞瘤,,,,dplyr,,,,流核,,,,FlowWorkspace,,,,GGFORCE,,,,ggnewscale,,,,GGPLOT2,,,,ggpointdenty,,,,ggpubr,,,,Ggrepel,grdevices,马格里特, 方法,pheatmap,,,,rcolorbrewer,,,,rlang,,,,RTSNE,,,,花花公子,,,,XML,,,,散点 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://www.r-project.orghttp://dambi.ugent.be |
取决于我 | |
进口我 | 催化剂,,,,细胞动力,,,,diffcyt,,,,Metacyto |
建议我 | hdcytodata |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | flowsom_2.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | flowsom_2.4.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowsom |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/流量 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/flowsom/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
文档»
生物导体