流动

doi:10.18129/b9.bioc.flowsom

使用自组织地图可视化和解释细胞术数据

生物导体版本:版本(3.15)

Flowsom通过使用自组织的地图聚类和最小的跨越树提供可视化选项,以提供细胞术数据的可视化选项。

作者:Sofie Van Gassen [AUT,CRE],Artuur Couckuyt [AUT],Katrien Quintelier [AUT],Annelies Emmaneel [Aut],Britt Callebaut [aut],Yvan Saeys [aut]

维护者:sofie van gassen

引用(从r内,输入引用(“流”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ flowsom”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“流”)

PDF R脚本 流动
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 2.4.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(7年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 4.0),Igraph
进口 统计,utils,生物基因,,,,柱面,,,,共识ClusterPlus,,,,细胞瘤,,,,dplyr,,,,流核,,,,FlowWorkspace,,,,GGFORCE,,,,ggnewscale,,,,GGPLOT2,,,,ggpointdenty,,,,ggpubr,,,,Ggrepel,grdevices,马格里特, 方法,pheatmap,,,,rcolorbrewer,,,,rlang,,,,RTSNE,,,,花花公子,,,,XML,,,,散点
链接
建议 生物使用,,,,测试
系统要求
增强
URL http://www.r-project.orghttp://dambi.ugent.be
取决于我
进口我 催化剂,,,,细胞动力,,,,diffcyt,,,,Metacyto
建议我 hdcytodata
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 flowsom_2.4.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉) flowsom_2.4.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowsom
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/流量
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/flowsom/
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  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户