Ga4ghclient.

DOI:10.18129 / b9.bioc.ga4ghclient

用于访问GA4GH API数据服务器的生物导体包

Bioconductor版本:释放(3.13)

Ga4ghclient提供了一种简单的方法,可以通过全球对基因组学和健康(GA4GH)基因组学API的全局联盟访问公共数据服务器。它提供对GA4GH API的低级访问,并将响应数据转换为基于生物导体的类对象。

作者:Welliton Souza [Aut,Cre],Benilton Carvalho [CTB],Cristiane Rocha [CTB]

维护者:Weliton Souza

引文(从R内,输入引文(“Ga4ghclient”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“ga4ghclient”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“GA4GHCLIEL”)

HTML. r script. Ga4ghclient.
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.16.0
在生物导体中以来 BIOC 3.5(R-3.4)(4年)
执照 GPL(> = 2)
依靠 S4Vectors.
进口 生物根系生物仪器dplyr.Genomeinfodb.Genomicranges.httr.绞喉雅思石, 方法,VariantAnnotation.
链接到
建议 annotationdbi.生物焦DT.knorg.hs.eg.db.RAMAMAMDOW.testthat.txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.
系统要求
加强
URL. https://github.com/labbcb/ga4ghclient.
Bugreports. https://github.com/labbcb/ga4ghclient/issues.
取决于我 Ga4ghshiny.
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 ga4ghclient_1.16.0.tar.gz.
Windows二进制文件 ga4ghclient_1.16.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) ga4ghclient_1.16.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/ga4ghclient.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包/ ga4ghclient
包短网址 https://biocumon.org/packages/ga4ghclient/
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