Bioconductor版本:释放(3.13)
Ga4ghclient提供了一种简单的方法,可以通过全球对基因组学和健康(GA4GH)基因组学API的全局联盟访问公共数据服务器。它提供对GA4GH API的低级访问,并将响应数据转换为基于生物导体的类对象。
作者:Welliton Souza [Aut,Cre],Benilton Carvalho [CTB],Cristiane Rocha [CTB]
维护者:Weliton Souza
引文(从R内,输入引文(“Ga4ghclient”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“ga4ghclient”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“GA4GHCLIEL”)
HTML. | r script. | Ga4ghclient. |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
版本 | 1.16.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 3.5(R-3.4)(4年) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | S4Vectors. |
进口 | 生物根系那生物仪器那dplyr.那Genomeinfodb.那Genomicranges.那httr.那绞喉那雅思石, 方法,VariantAnnotation. |
链接到 | |
建议 | annotationdbi.那生物焦那DT.那kn那org.hs.eg.db.那RAMAMAMDOW.那testthat.那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | https://github.com/labbcb/ga4ghclient. |
Bugreports. | https://github.com/labbcb/ga4ghclient/issues. |
取决于我 | Ga4ghshiny. |
进口我 | |
建议我 | |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
源包 | ga4ghclient_1.16.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | ga4ghclient_1.16.0.zip. |
Macos 10.13(高塞拉) | ga4ghclient_1.16.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/ga4ghclient. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondudard.org:包/ ga4ghclient |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/ga4ghclient/ |
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