GDSArray

DOI:10.18129 / B9.bioc.GDSArray

将GDS文件表示为类数组对象

Bioconductor版本:发行版(3.15)

GDS文件被广泛用于表示基因分型或序列数据。GDSArray包实现了' GDSArray '类，以类似矩阵的形式表示GDS文件中的节点，允许在_R_中轻松操作(例如，子集，数学转换)。数据一直保存在磁盘上，直到需要时才可以处理非常大的文件。

作者:刘谦[aut, cre]， Martin Morgan [aut]， Hervé Pagès [aut]，郑秀文[aut]

维护者:Qian Liu

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GDSArray")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“GDSArray”)

超文本标记语言	R脚本	GDSArray:将GDS文件表示为类数组对象
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (R-3.5)(4年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5),gdsfmt、方法、BiocGenerics，DelayedArray(> = 0.5.32)
进口	工具,S4Vectors(> = 0.17.34),SNPRelate，SeqArray
链接
建议	testthat，knitr，减价，rmarkdown，BiocStyle，BiocManager
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/Bioconductor/GDSArray
BugReports	https://github.com/Bioconductor/GDSArray/issues
取决于我
进口我	CNVRanger，VariantExperiment
建议我	DelayedDataFrame
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	GDSArray_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	GDSArray_1.16.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	GDSArray_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GDSArray
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GDSArray
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GDSArray/
包下载报告	下载数据