GGPA

doi：10.18129/b9.bioc.ggpa

Graph-GPA：用于优先级GWAS结果和研究多效体结构的图形模型

生物导体版本：版本（3.15）

全基因组关联研究（GWAS）是一种广泛使用的工具，用于鉴定与表型和疾病相关的遗传变异，尽管复杂疾病具有许多具有许多遗传变异的疾病，这些遗传变异具有很小的效果，这对于传统的这些研究而言。通过利用多效性，可以提高单个GWA的统计能力。该软件包提供了用于拟合Graph-GPA的功能，这是一个统计框架，可以通过整合多效性来确定GWAS结果的优先级。“ GGPA”软件包提供了用户友好的接口，以适合Graph-GPA模型，实现关联映射并生成表型图。

作者：Dongjun Chung，Hang J. Kim，Carter Allen

维护者：dongjun chung

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ GGPA”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ GGPA”）

PDF	R脚本	GGPA
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.8.0
在生物导体中	Bioc 3.11（R-4.0）（2年）
执照	GPL（> = 2）
要看	R（> = 4.0.0），统计，方法，图形，ggally，，，，网络，，，，sna，，，，秤，，，，矩阵
进口	RCPP（> = 0.11.3）
链接	RCPP，，，，rcpparmadillo
建议	生物使用
系统要求	gnu做
增强
URL	https://github.com/dongjunchung/ggpa/
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	ggpa_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	ggpa_1.8.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	ggpa_1.8.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggpa
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/ggpa
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/ggpa/
软件包下载报告	下载统计